| aufnehmender Verein | Name | Transferdatum | Position | News
| Jahn Regensburg | Koke | 01.02.2013 Sturm vereinslos
| | MSV Duisburg | Ibertsberger, Andreas | 31.01.2013 | Abwehr |
| | MSV Duisburg | Dum, Sascha | 31.01.2013 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Kaiser, Sandro | 31.01.2013 | Abwehr |
| | FSV Frankfurt | Brown Forbes, Felicio | 31.01.2013 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | de Guzman, Julian | 31.01.2013 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Hendl, Bernhard | 31.01.2013 | Tor |
| | SV Sandhausen | Beichler, Daniel | 31.01.2013 | Mittelfeld |
| | 1860 München | Fathi, Malik | 31.01.2013 | Abwehr |
| | FC Ingolstadt | Micanski, Ilijan | 31.01.2013 | Sturm |
| | SV Sandhausen | Mäkelä, Juho | 31.01.2013 | Sturm |
| | SV Sandhausen | Yun, Jutae | 30.01.2013 | Sturm |
| | 1. FC Kaiserslautern | Hoffer, Erwin | 30.01.2013 | Sturm |
| | FC Ingolstadt | Jessen, Leon | 30.01.2013 | Abwehr |
| | Dynamo Dresden | Streker, Denis | 30.01.2013 | Mittelfeld |
| | SV Sandhausen | Olajengbesi, Seyi | 30.01.2013 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Nascimento, Bruno | 29.01.2013 | Abwehr |
| | Energie Cottbus | Schulze, Michael | 29.01.2013 | Abwehr |
| | FSV Frankfurt | Jönsson, Rasmus | 29.01.2013 | Sturm |
| | Energie Cottbus | Mosquera, John Jairo | 28.01.2013 | Sturm |
| | VfL Bochum | Lumb, Michael | 25.01.2013 | Abwehr |
| | Dynamo Dresden | Khlebosolov, Dmitri | 25.01.2013 | Sturm |
| | Union Berlin | Özbek, Baris | 25.01.2013 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Karl, Markus | 24.01.2013 | Mittelfeld |
| | 1860 München | Friend, Rob | 24.01.2013 | Angriff |
| | Jahn Regensburg | Ochs, Timo | 23.01.2013 | Tor |
| | VfR Aalen | Abe, Takuma | 22.01.2013 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Kempe, Tobias | 21.01.2013 | Mittelfeld |
| | 1860 München | Kamara, Ola | 20.01.2013 | Angriff |
| | Eintracht Braunschweig | Elabdellaoui, Omar | 19.01.2013 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserlsautern | Köhler, Benjamin | 18.01.2013 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Carlinhos | 15.01.2013 | Abwehr |
| | Energie Cottbus | Fomitschow, André | 14.01.2013 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Löwe, Chris | 12.01.2013 | Abwehr |
| | 1. FC Kaiserslautern | Drazan, Christopher | 11.01.2013 | Mittelfeld |
| | FC Erzgebirge Aue | Kastrati, Flamur | 10.01.2013 | Angriff |
| | 1. FC Köln | Maierhofer, Stefan | 09.01.2013 | Angriff |
| | SC Paderborn | Saglik, Mahir | 07.01.2013 | Angriff |
| | Energie Cottbus | Dahm, Martin | 06.01.2013 | Abwehr |
| | SC Paderborn | Kachunga, Elias | 03.01.2013 | Angriff |
| | 1. FC Kaiserslautern | Weiser, Mitchell | 02.01.2013 | Mittelfeld |
| | Energie Cottbus | Bickel, Christian | 02.01.2013 | Mittelfeld |
| | Erzgebirge Aue | Pezzoni, Kevin | 21.12.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Novakovic, Milivoje | 21.12.2012 | Angriff |
| | Erzgebirge Aue | Fink, Michael | 05.12.2012 | Mittelfeld |
| | SC Paderborn 07 | Lück, Daniel | 13.11.2012 | Tor |
| | Hertha BSC | Pekarik, Peter | 31.08.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Ujah, Anthony | 31.08.2012 | Angriff |
| | MSV Duisburg | Onuegbu, Kingsley | 31.08.2012 | Angriff |
| | VfR Aalen | Bigalke, Sascha | 31.08.2012 | Mittelfeld |
| | SV Sandhausen | Naki, Deniz | 31.08.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Köln | Riedel, Florian | 30.08.2012 | Abwehr |
| | SC Paderborn | Gyau, Joseph-Claude | 30.08.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Buchtmann, Christopher | 30.08.2012 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Kamavuaka, Wilson | 30.08.2012 | Abwehr |
| | Dynamo Dresden | Jänicke, Tobias | 30.08.2012 | Angriff
| | FC Ingolstadt | Roger | 29.08.2012 | Abwehr |
| | Jahn Regensburg | Wießmeier, Julian | 29.08.2012 | Mittelfeld |
| | Dynamo Dresden | Kitambala, Lynel | 27.08.2012 | Angriff
| | 1. FC Kaiserslautern | Torrejon, Marc | 26.08.2012 | Abwehr |
| | SV Sandhausen | Wooten, Andrew | 23.08.2012 | Angriff |
| | SV Sandhausen | Zhang, Chengdong | 23.08.2012 | Angriff |
| | Eintracht Braunschweig | Baumjohann, Alexander | 21.08.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Sliskovic, Petar | 21.08.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Avevor, Christopher | 17.08.2012 | Abwehr |
| | Jahn Regensburg | Djuricin, Marco | 09.08.2012 | Angriff |
| | VfL Bochum | Ortega, Michael | 07.08.2012 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Roshi, Odise | 06.08.2012 | Mittelfeld |
| | Energie Cottbus | Rivic, Stiven | 06.08.2012 | Mittelfeld |
| | Union Berlin | Gallegos, Felipe | 03.08.2012 | Mittelfeld |
| | MSV Duisburg | da Silva, Antonio | 03.08.2012 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Rahn, Christian | 02.08.2012 | Abwehr |
| | Erzgebirge Aue | Wiegel, Andreas | 01.08.2012 | Angriff |
| | SC Paderborn | Yilmaz, Deniz | 31.07.2012 | Abwehr |
| | SC Paderborn | Hofmann, Philipp | 30.07.2012 | Angriff |
| | 1. FC Kaiserslautern | Idrissou, Mohamadou | 27.07.2012 | Angriff |
| | MSV Duisburg | Jovanovic, Ranisav | 26.07.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Ouali, Idir | 25.07.2012 | Mittelfeld |
| | Union Berlin | Nemec, Adam | 24.07.2012 | Angriff |
| | FC St. Pauli | Kringe, Florian | 24.07.2012 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Bambara, Moise | 23.07.2012 | Mittelfeld |
| | Dyamo Dresden | Pepic, Hasan | 20.07.2012 | Angriff |
| | VfL Bochum | Tasaka, Yusuke | 20.07.2012 | Mittelfeld |
| | Hertha BSC | Sahar, Ben | 19.07.2012 | Angriff |
| | Hertha BSC | Allagui, Sami | 19.07.2012 | Angriff |
| | Hertha BSC | Wagner, Sandro | 19.07.2012 | Angriff |
| | Energie Cottbus | Rippert, Guillaume | 18.07.2012 | Abwehr |
| | Union Berlin | Puncec, Roberto | 16.07.2012 | Abwehr |
| | 1860 München | Blanco, Ismael | 16.07.2012 | Angriff |
| | VfR Aalen | Serejo, Daniel | 12.07.2012 | Mittelfeld |
| | VfR Aalen | Schiele, Benjamin | 12.07.2012 | Angriff |
| | Jahn Regensburg | Sembolo, Francky | 12.07.2012 | Angriff |
| | FC St. Pauli | Himmelmann, Robin | 12.07.2012 | Tor |
| | Jahn Regensburg | Machado, Ramon | 11.07.2012 | Angriff |
| | FC St. Pauli | Gogia, Akaki | 11.07.2012 | Mittelfeld |
| | 1860 München | Makos, Grigoris | 10.07.2012 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Verhoek, John | 06.07.2012 | Angriff |
| | FSV Frankfurt | Jung, Anthony | 05.07.2012 | Abwehr |
| | Energie Cottbus | Sanogo, Boubacar | 04.07.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Fromlowitz, Florian | 04.07.2012 | Tor |
| | FC Ingolstadt | da Costa, Danny | 03.07.2012 | Abwehr |
| | Hertha BSC | Ndjeng, Marcel | 28.06.2012 | Mittelfeld |
| | Union Berlin | Schönheim, Fabian | 26.06.2012 | Abwehr |
| | Hertha BSC | Kluge, Peer | 26.06.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Köln | Wimmer, Kevin | 24.06.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Royer, Daniel | 24.06.2012 | Mittelfeld |
| | Hertha BSC | Kachunga, Elias | 22.06.2012 | Angriff |
| | FC St. Pauli | Thy, Lennart | 22.06.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Müller, Tobias | 22.06.2012 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Müller, Marius | 20.06.2012 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Altinay, Koray | 20.06.2012 | Angriff |
| | FSV Frankfurt | Schick, Robert | 20.06.2012 | Abwehr |
| | VfR Aalen | Buballa, Daniel | 19.06.2012 | Abwehr |
| | 1. Fc Kaiserslautern | Hajri, Enis | 19.06.2012 | Abwehr |
| | FSV Frankfurt | Leckie, Mathew | 19.06.2012 | Angriff |
| | 1860 München | Tomasov, Marin | 18.06.2012 | Mittelfeld |
| | Dynamo Dresden | Thoelke, Bjarne | 18.06.2012 | Abwehr |
| | VfR Aalen | Barth, Oliver | 18.06.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Lehmann, Matthias | 18.06.2012 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Kotzke, Jonatan | 18.06.2012 | Abwehr |
| | 1860 München | Stoppelkamp, Moritz | 17.06.2012 | Mittelfeld |
| | VfR Aalen | Junglas, Manuel | 16.06.2012 | Mittelfeld |
| | Eintracht Braunschweig | Ademi, Orhan | 16.06.2012 | Angriff |
| | Erzgebirge Aue | Sylvestr, Jakub | 16.06.2012 | Angriff |
| | VfR Aalen | Zimmermann, Nico | 15.06.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Nsor, Kwame | 15.06.2012 | Angriff |
| | FC St. Pauli | Ginczek, Daniel | 15.06.2012 | Angriff |
| | 1. FC Kaiserslautern | Amri, Chadli | 15.06.2012 | Mittelfeld |
| | Energie Cottbus | Farina, Nicolas | 14.06.2012 | Mittelfeld |
| | Erzgebirge Aue | Neukam, Tom | 11.06.2012 | Tor |
| | FC Ingolstadt | Mijatovic, Andre | 09.06.2012 | Abwehr |
| | Erzgebirge Aue | Munteanu, Vlad | 06.06.2012 | Mittelfeld |
| | VfL Bochum | Iashvili, Alexander | 06.06.2012 | Angriff |
| | 1. FC Köln | Maroh, Dominic | 06.06.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Giannoulis, Konstantinos | 06.06.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Basala-Mazana, Bienvenue | 06.06.2012 | Abwehr |
| | Jahn Regensburg | Weidlich, Denis | 05.06.2012 | Mittelfeld |
| | 1860 München | Volz, Moritz | 05.06.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Kaiserslautern | Zuck, Hendrick | 04.06.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Micanski, Ilijan | 04.06.2012 | Angriff |
| | MSV Duisburg | Perthel, Timo | 04.06.2012 | Abwehr |
| | FSV Frankfurt | Pellowski, Jannis | 02.06.2012 | Torwart |
| | FSV Frankfurt | Nefiz, Emre | 02.06.2012 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Kaffenberger, Marcel | 02.06.2012 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Azaouagh, Ahmed | 02.06.2012 | Mittelfeld |
| | FC Ingolstadt | Groß, Pascal | 01.06.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Köln | Strobl, Tobias | 01.06.2012 | Abwehr |
| | Jahn Regensburg | Haag, Patrick | 01.06.2012 | Mittelfeld |
| | SV Sandhausen | Morena, Fabio | 31.05.2012 | Abwehr |
| | Hertha BSC | Knoll, Marvin | 31.05.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Köln | Bröker, Thomas | 30.05.2012 | Angriff |
| | SC Paderborn | Lange, Sebastian | 30.05.2012 | Tor |
| | SC Paderborn | Ornatelli, Massimo | 30.05.2012 | Mittelfeld |
| | Jahn Regensburg | Amachaibou, Abdenour | 30.05.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Losilla, Anthony | 29.05.2012 | Mittelfeld |
| | SV Sandhausen | Langer, Michael | 29.05.2012 | Tor |
| | SC Paderborn | Gulde, Manuel | 29.05.2012 | Abwehr |
| | FC Ingolstadt | Uludag, Alper | 28.05.2012 | Mittelfeld |
| | FC Ingolstadt | Ofosu, Reagy | 28.05.2012 | Angriff |
| | VfL Bochum | Scheidhauer, Kevin | 25.05.2012 | Angriff |
| | VfR Aalen | Reichwein, Marcel | 25.05.2012 | Angriff |
| | Erzgebirge Aue | Nickenig, Tobias | 25.05.2012 | Abwehr |
| | SV Sandhausen | Falkenberg, Kim | 25.05.2012 | Abwehr |
| | VfR Aalen | Hübner, Benjamin | 25.05.2012 | Abwehr |
| | FC Ingolstadt | Korkmaz, Ümit | 24.05.2012 | Mittelfeld |
| | Energie Cottbus | Stiepermann, Marco | 24.05.2012 | Angriff |
| | 1. FC Kaiserslautern | Alushi, Enis | 24.05.2012 | Mittelfeld |
| | FSV Frankfurt | Kapllani, Edmond | 24.05.2012 | Angriff |
| | VfR Aalen | Klauß, Michael | 24.05.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Scholz, Markus | 24.05.2012 | Tor |
| | 1. FC Kaiserslautern | Hohs, David | 23.05.2012 | Tor |
| | FSV Frankfurt | Pirson, Sören | 22.05.2012 | Tor |
| | VfR Aalen | Kampl, Kevin | 21.05.2012 | Mittelfeld |
| | SC Paderborn | Poljanec, David | 20.05.2012 | Angriff |
| | SV Sandhausen | Tüting, Simon | 18.05.2012 | Mittelfeld |
| | FC Ingolstadt | Eigler, Christian | 18.05.2012 | Angriff |
| | SV Sandhausen | Riemann, Alexander | 17.05.2012 | Angriff |
| | Eintracht Braunschweig | Kratz, Kevin | 16.05.2012 | Mittelfeld |
| | Union Berlin | Haas, Daniel | 15.05.2012 | Tor |
| | SC Paderborn | Zeitz, Manuel | 14.05.2012 | Mittelfeld |
| | VfR Aalen | Fejzic, Jasmin | 14.05.2012 | Tor |
| | Eintracht Braunschweig | Kluft, Björn | 11.05.2012 | Mittelfeld |
| | SV Sandhausen | Achenbach, Timo | 11.05.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Kaiserslautern | Vermouth, Gil | 11.05.2012 | Mittelfeld |
| | Erzgebirge Aue | Miatke, Nils | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | Eintracht Braunschweig | Erwig-Drüppel, Jonas | 10.05.2012 | Angriff |
| | FSV Frankfurt | Heubach, Tim | 10.05.2012 | Abwehr |
| | SC Paderborn | Ziegler, Patrick | 10.05.2012 | Abwehr |
| | SC Paderborn | Vrancic, Mario | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | SC Paderborn | Feisthammel, Tobias | 10.05.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Yabo, Reinhold | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | Hertha BSC | Radjabali-Fardi, Shervin | 10.05.2012 | Abwehr |
| | 1860 München | Vollmann, Korbinian | 10.05.2012 | Angriff |
| | 1860 München | Wojtkowiak, Grzegorz | 10.05.2012 | Abwehr |
| | MSV Duisburg | Brandy, Sören | 10.05.2012 | Angriff |
| | SV Sandhausen | Adler, Nicky | 10.05.2012 | Angriff |
| | 1. FC Köln | Matuschyk, Adam | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | Energie Cottbus | Glasner, Sebastian | 10.05.2012 | Angriff |
| | 1. FC Köln | Schorch, Christopher | 10.05.2012 | Abwehr |
| | MSV Duisburg | Lachheb, Adli | 10.05.2012 | Abwehr |
| | SC Paderborn | Kempe, Tobias | 10.05.2012 | Abwehr |
| | Erzgebirge Aue | Gercaliu, Ronald | 10.05.2012 | Abwehr |
| | VfL Bochum | Rzatkowski, Marc | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | VfL Bochum | Brügmann, Florian | 10.05.2012 | Abwehr |
| | VfL Bochum | Chaftar, Mounir | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | Union Berlin | Kopplin, Björn | 10.05.2012 | Abwehr |
| | VfL Bochum | Heerwagen, Philipp | 10.05.2012 | Tor |
| | VfL Bochum | Rothenbach, Carsten | 10.05.2012 | Abwehr |
| | FC St. Pauli | Gonther, Sören | 10.05.2012 | Abwehr |
| | FC St. Pauli | Mohr, Florian | 10.05.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Kessler, Thomas | 10.05.2012 | Tor |
| | VfL Bochum | Dedic, Zlatko | 10.05.2012 | Angriff |
| | Dynamo Dresden | Köz, Cüneyt | 10.05.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Schuhen, Marcel | 10.05.2012 | Tor |
| | FC St. Pauli | Kirschke, Florian | 10.05.2012 | Tor |
| | FC St. Pauli | Andrijanic, Marcel | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Köln | Kübler, Lukas | 10.05.2012 | Abwehr |
| | 1. FC Köln | Schuhen, Marcel | 10.05.2012 | Tor |
| | 1. FC Köln | Schnellhardt, Fabian | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Wooten, Andrew | 10.05.2012 | Angriff |
| | FC St. Pauli | Kirschke, Florian | 10.05.2012 | Tor |
| | FC St. Pauli | Andrijanic, Marcel | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Müller, Marius | 10.05.2012 | Tor |
| | 1860 München | Vocaj, Liridon | 10.05.2012 | Mittelfeld |
| | SV Sandhausen | Hiegl, Michael | 10.05.2012 | Tor |
| | Energie Cottbus | Brinkmann, Daniel | 09.05.2012 | Mittelfeld |
| | MSV Duisburg | Koch, Julian | 09.05.2012 | Abwehr |
| | VfL Bochum | Bertram, Sören | 09.05.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Azaouagh, Mimoun | 09.05.2012 | Mittelfeld |
| | 1. FC Kaiserslautern | Bunjaku, Albert | 09.05.2012 | Angriff |
| | Union Berlin | Terodde, Simon | 02.05.2012 | Angriff |
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